Неоготический храм за полтора столетия существования претерпел один серьёзный ремонт и одну реконструкцию. Ремонтировали церковь Святого Иоанна сразу после Второй мировой войны – возле него разорвались несколько крупных авиабомб, причинивших серьёзный ущерб стенам и окнам. Реконструировали здание в столетнему юбилею, тогда изменения коснулись интерьеров – часть оригинальных росписей сняли со стен и перенесли в музей, а места, на которых они находились, заштукатурили.
Нынешний орган – второй. Первый установили в 1891 году, четырежды ремонтировали, но в 2005 году решили, что свой ресурс он исчерпал, и установили новый, фирмы «Кристиан Шеффлер».