Историки указывают, что первое здание храма было возведено еще в 1070-1080 годах и простояло не более чем 50 лет. В византийский период существования церковь неоднократно перестраивалась, дополнялась новыми структурными элементами.
После взятие Константинополя турками в 1453 году здание приспособили под мечеть и возвели величественный минарет. Все мозаики были закрыты краской, а местами даже заштукатурены. В 50-х годах прошлого века в мечети прошла реконструкция, все изображения были вновь обретены. Вплоть до 2020 года здесь функционировал музей Карие. Предполагается, что после решения, принятого турецким правительством о возобновлении в здании исламских богослужений, все мозаики и фрески будут снова закрыты специальными баннерами и щитами.